Publikationstyp: Konferenz: Sonstiges
Art der Begutachtung: Peer review (Abstract)
Titel: Dynamic DNA damage and repair modeling : bridging the gap between experimental damage readout and model structure
Autor/-in: Weyland, Mathias
Thumser-Henner, Pauline
Rohrer Bley, Carla
Ulzega, Simone
Petri-Fink, Alke
Lattuada, Marco
Scheidegger, Stephan
Füchslin, Rudolf Marcel
Angaben zur Konferenz: XIII International Workshop on Artificial Life and Evolutionary Computation (WIVACE), Parma, Italy, 10-12 September 2018
Erscheinungsdatum: 2018
Sprache: Englisch
Fachgebiet (DDC): 572: Biochemie
Zusammenfassung: In this work, a method is presented to map a set of experimentally obtained, time-resolved distributions to a dynamic model. Specifically, time-resolved comet assay readouts of cancer cells after application of ionizing radiation are mapped to the Multi-Hit-Repair model, a radiobiologically motivated dynamic model used to predict DNA damage and repair. Differential evolution is used for parameter-search to showcase the potential of this method, producing a prediction close to the experimental measurement. The results obtained from the parameter search are used to characterize aspects of the repair process. The method is compared to prior attempts of finding model parameters from dose-response curves, revealing that calibration is required to render the two comparable.
Weitere Angaben: Oral presentation
Volltext Version: Publizierte Version
Lizenz (gemäss Verlagsvertrag): Lizenz gemäss Verlagsvertrag
Departement: Life Sciences und Facility Management
Organisationseinheit: Institut für Computational Life Sciences (ICLS)
Publiziert im Rahmen des ZHAW-Projekts: Phantom- and Model-based Optimisation of Medical Imaging Modalities
Enthalten in den Sammlungen:Publikationen Life Sciences und Facility Management

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