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Titel: Erwinia species identification using matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry
Autoren: Rezzonico, Fabio
Duffy, Brion
Smits, Theo H.M.
Pothier, Joël F.
Erschienen in: Journal of Plant Pathology
Band(Heft): 99
Heft: Special issue
Seiten: 121
Seiten bis: 129
Verlag / Hrsg. Institution: Edizioni E T S
Erscheinungsdatum: Nov-2017
Sprache: Englisch / English
Schlagwörter: Bacterial identification; MALDI-TOF MS; Taxonomy; Fire blight
Fachgebiet (DDC): 570: Biologie
Zusammenfassung: Rapid and reliable identification of plant pathogenic bacteria is critical for effective implementation of phytosanitary measures. The genus Erwinia includes a number of economically important plant pathogens such as fire blight agent Erwinia amylovora or Asian pear pathogen Erwinia pyrifoliae, together with closely related plant epiphytes of unknown pathogenicity or even with a potential use for biological control like Erwinia tasmaniensis or Erwinia billingiae, respectively. Current laboratory methods to achieve satisfactory identification and discrimination between species within the Erwinia genus are based on the isolation on semi-selective media, serology, specific PCR and gene locus sequencing: these approaches are complicated and time-consuming, often requiring a priori assumptions over the identity of the isolates. Here we present a streamlined approach based on whole-cell Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) based on the AXIMA mass spectrometer of Shimadzu-Biotech Corp that demonstrates the potential of this technology for quick species identification in plant diagnostics within the genus Erwinia.
Departement: Life Sciences und Facility Management
Organisationseinheit: Institut für Umwelt und Natürliche Ressourcen (IUNR)
Publikationstyp: Beitrag in wissenschaftlicher Zeitschrift / Article in scientific Journal
DOI: 10.4454/jpp.v99i0.3916
10.21256/zhaw-1519
ISSN: 2239-7264
URI: https://digitalcollection.zhaw.ch/handle/11475/1739
Enthalten in den Sammlungen:Publikationen Life Sciences und Facility Management

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